問題 390140： EP3C5、EP3C10、EP3C16、EP3C55、EP3C80、EP3C120 裝置針腳輸出表版本 1.3 和 EP3C25、EP3C40 裝置針腳輸出表版本 1.4
在 Cyclone® III 裝置的針腳資訊中。MSEL[3：0] 狀態：
「設定Cyclone III 裝置配置方案的組態輸入針腳。這些針腳必須硬連到 VCCA 或 GND。有些較小的裝置或套件選項不支援 AP 快閃程式設計，也不支援 MSEL[3] 針腳。」
但此聲明將擴充至也包含主動循序的限制：
「設定Cyclone III 裝置配置方案的組態輸入針腳。這些針腳必須用硬連到 VCCA 或 GND。較小的Cyclone III 裝置或封裝選項 （E144、M164、Q240、F256 和 U256 套件） 沒有 MSEL[3] 針腳。沒有 MSEL[3] 針腳，Cyclone III 裝置不支援採用 3.0-V 或 2.5 V 配置電壓標準的 AS Fast POR 設定方案和 AP 配置方案。」
問題10002282：EP3C16 裝置插腳表版本 1.3
針腳DIFFIO_B6p被列為差分對正針腳。然而，差分對沒有負針DIFFIO_B6n。裝置釘出檔案不應將DIFFIO_B6p標記為具有選用的差分針腳功能。
問題10003625：EP3C10 裝置插腳表格版本 1.3
有標示為DIFFIO_T6n的針腳，但是沒有DIFFIO_T6p。此裝置密度沒有DIFFIO_T6 LVDS 對，因此DIFFIO_T6n標籤將在未來修訂的針腳表格中移除。
問題10005628：EP3C5 裝置插腳表版本 1.3
有標示為DIFFIO_T6n的針腳，但是沒有DIFFIO_T6p。此裝置密度沒有DIFFIO_T6 LVDS 對，因此DIFFIO_T6n標籤將在未來修訂的針腳表格中移除。